Kchip1 CEL 파일을 vcf , plink format 파일로 만들기 마이크로어레이를 수행하고 나온 데이터는 CEL이란 확장자를 가진 파일로 나온다. CEL 파일은 Affymetrix DNA 마이크로 어레이 이미지 분석 소프트웨어에 의해 생성 된 데이터 파일이다. 이러한 CEL 파일을 분석하기 위해 vcf로 바꾸거나 plink format으로 바꾼다. CEL 파일을 PLINK format으로 바꾸려면?? (kchip version1.1 일 때) Analysis Power Tools (APT) 사용 apt-geno-qc apt-genotype-axiom apt-format-result 위의 3가지 스텝을 주로 사용하여 분석을 한다. 그 후 vcf 로 만든 파일을 plink command를 사용하여 plink binary file로 변환한다. plink --vcf --make.. 2021. 1. 25. 이전 1 다음
