Eagle1 Phasing 하기 Phasing 이란? 쉽게 말하면 나의 diploid 유전형을 아빠의 haploid와 엄마의 haploid로 구분해주는 과정 예) 나의 유전형이 1이라면 0|1 이런식으로 누구에게서 왔는지 알 수 있게 해줌. eagle이라는 툴을 사용하면 쉽게 할 수 있음 plink 파일(bed, bim, fam) 을 사용하여 수행해봄 ./Eagle/Eagle_v2.4.1/eagle --bfile {plink_file_name} --geneticMapFile ./Eagle/Eagle_v2.4.1/genetic_map_hg38_withX.txt --outPrefix {output_name} --numThreads 16 geneticMapFile은 Eagle 메뉴얼 페이지 가서 읽어보고 받아오면 됨. https://alke.. 2023. 12. 4. 이전 1 다음